Účelem Vodního díla Gabčíkovo je zejména ochrana před povodněmi, které na přilehlém území Dunaje způsobily víckrát katastrofické záplavy.
Vodní dílo Gabčíkovo zajišťuje plynulou celoroční plavbu lodí, poskytuje elektřinu v množství cca 8% roční spotřeby Slovenské republiky.
Gabčíkovo - vodní dílo má velmi významnou roli v stabilizaci koryta Dunaje a vytvořilo tak podmínky pro ochranu vnitrozemské delty Dunaje i rekreační rozvoj přilehlého území.