Účelem Vodního díla Gabčíkovo je zejména ochrana před povodněmi, které na přilehlém území Dunaje způsobily vícekrát katastrofické záplavy.
Vodní dílo Gabčíkovo zajišťuje plynulou celoroční plavbu lodí, poskytuje elektřinu v množství cca 8% roční spotřeby České republiky.
Gabčíkovo - vodní dílo má velmi významnou roli v stabilizaci koryta Dunaje a vytvořilo tak podmínky pro ochranu vnitrozemské delty Dunaje i možnosti pro rekreační rozvoj celého přilehlého území.